菌落总数是指在一定条件下（如培养基营养成分、培养基pH、培养温度和时间、菌种的需氧性等）每克（每毫升）检样所生长出来的细菌菌落总数。

菌落总数是指示性微生物指标，主要用来评价食品清洁度，反映食品在生产过程中是否符合卫生要求。食品的菌落总数超标，将会破坏食品的营养成分，加速食品的腐败变质，使食品失去食用价值。

食品中的菌落总数超标，可能是企业未按要求严格控制生产加工过程的卫生条件，或者包装容器消毒不到位；还有可能与产品包装密封不严，储运条件控制不当等有关。